Основные коллекции Моравской галереи располагаются в трех разных зданиях, время и условия работы которых отличаются.
Главным историческим зданием Моравской галереи является Музей прикладного искусства, расположенный по адресу ул. Гусова, 14 (местное его название — Uměleckoprůmyslové muzeum). В этом здании, перешедшем в ведомство Моравской галереи в 1961 г., располагается одна из самых ярких коллекций декоративно-прикладного искусства.
Неподалеку, на Гусова, 18, находится Музей современного искусства (Pražákův palác).
Третьим зданием галереи является Музей искусств от периода готики до XIX вв. (здание Místodržitelský palác, примыкающее к церкви Св. Фомы).
К Моравской галерее также относятся несколько других зданий, расположенных в разных частях города.